أمر عدد 246 لسنة 2025 مؤرخ في 8 ماي 2025، صادر عن رئيس الجمهورية قيس سعيد ومنشور بالرائد الرسمي عدد 54 بتاريخ 9 ماي 2025، يضبط التنظيم الإداري والمالي للمجلس الأعلى للتربية والتعليم. في الباب الأول المتعلق بالتنظيم الإداري، يسير إدارة المجلس كاتب عام يتولى إعداد اجتماعات هيئات المجلس ولجانه وتحرير محاضرها وحفظها، والتنسيق بين هياكله، والإشراف على إعداد التقرير السنوي، وإعداد مشروع الميزانية ومتابعة تنفيذها، والتصرف في الشؤون الإدارية والمالية. وتنظم الكتابة العامة في إدارات وإدارات فرعية ومصالح، ويحدد رئيس المجلس الخطط الوظيفية. وفي الباب الثاني، رئيس المجلس هو الآمر بالصرف، وتتكون الموارد من اعتمادات ميزانية الدولة والموارد المرخص فيها، والنفقات من نفقات التسيير والتأجير وغيرها، ويعين لدى المجلس محاسب عمومي.